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第4章 超算中心（第2页）

“是‘能量最低’原理。”调代码的小伙子摘下耳机，转身对她说道，“但是初测值的实验方式不同，这两种算法压根儿不能通用。”

“谁说的？第一对氢键赋值根本不影响。你先试试吧。”祁旻对他说道。

小伙子将信将疑地加上了一段儿if，从另外一个单纯使用能量最低原理的算法里复制出了相关代码。

他再运行之后，输出的矩阵里果然不全是负数了。

但很明显结果也不对。

负数还是太多了，导致最大值才只有不到4，而很明显用于测试的那段30个碱基的线性rna不可能只形成一个碱基配对。

“这又是怎么回事儿？”小伙子这回直接对她问道。

祁旻凑到屏幕前仔细看了看，而后一边敲着键盘一边说道：“你这个对比最大值的嵌套for语句里没有加flag，只要加上就好了……”

代码再运行了一遍，这回输出的矩阵终于看起来正常了。

小伙子松了口气儿，刚要从椅子上站起来，祁旻却说道：“哎，这还是不对。你看这段rna的已知结构，这里面有三个loop，但你的算法算出来有四个……哦，我知道了，还得加一个防止无效配对的if，连续两个碱基以下的配对不应该存在。”

她把这个if语句加进去之后，最终画出的rna二级结构终于和已知结构一样了。

“呃……你还真……”小伙子看着屏幕上的图像，不自觉地露出了一丝傻笑。

而后他看了一眼祁旻，有些奇怪地问道：“你是新来的？我记得今年我们这儿不招博士生了——你是技术员？”

“没，我就是来找周晓姗老师有点儿事儿。”祁旻笑着说道。

“什么事儿？”小伙子问道，而后像是意识到这个问题有点儿侵犯别人隐私，于是补充道，“或许我也能帮你一下儿。”

“还真没准儿。”祁旻从他的屏幕面前移开，“我来找周晓姗老师是为了能用一下儿‘雨云’。”

“哦，那好说啊。”小伙子立刻答应道，“如果我老板不同意，你还能用我的号。”

“这样还是不太好吧……”祁旻有些尴尬地笑了笑。跑类脑体占用的计算资源可是非常多的，如果是偷偷用某个博士生的号，肯定会引起管理员的怀疑。

“那有什么的？”小伙子无所谓地说，“‘雨云’的计算能力这么强，一般的项目根本不是事儿。老板就是想弄点儿大项目，测试一下儿它的实际计算能力，才召了我们这些个做生物的人来到处接活儿。说实话，我在来这儿之前都没怎么学过python。”

看得出来。祁旻在心里默默地评价了一句，而后又开玩笑地问：“那要是周晓姗老师把我拒了，我可就真来借你的号了？”

“行，当然行。”小伙子立刻说道，“来加个微信，到时候这个rna算法出bug了，我还得再找你呢。”（）;

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